Sappiamo che nel 1470 Bartolomeo Dell'Alpa si impegnò a costruire un organo in 8 mesi al prezzo di 112 ducati d'oro, oltre all'alloggio. Il 19 ott. 1509 il sacerdote Michele Gariverto ebbe l'incarico di ricostruire lo strumento, dovendo lo stesso essere spostato per la costruzione di un nuovo altare. Sappiamo ancora di un organo costruito nel 1539 da Giovanni Battista Facchetti, che alla fine del 500 fu sostituto da Bernardino e Paolo Molinini. Nel 1666 vi furono effettuati dei restauri da Francesco Grasselli. Nel 1829 ne fu montato uno dei fratelli Carlo e Giovanni Gianfré, che ritirarono il vecchio, scontando dal prezzo 1500 lire nuove di Parma. Un altro organo, opera di Carlo e Giuseppe Serassi, fu inaugurato il 17 ott. 1818 con un concerto di Giuseppe Nicolini (G.Pr, n. 17, ott. 1818). Veniva riveduto nel 1835 dai fratelli Lingiardi di Pavia e nel 1862 da Antonio Sangalli, residente in Piacenza. Giovanni Tamburini di Crema nel 1900 ebbe l'incarico di costruire un nuovo organo, utilizzando il materiale del Serassi: consegnato nel 1902, fu inaugurato con 2 concerti di Marco Enrico Bossi. Di recente h stato completamente restaurato. Nella cripta, infine, vi h un organo della ditta Tamburini del 1901, che ha sostituito uno di Antonio Sangalli del 1861.
Tra gli organisti si ricordano:
Gaspero Villani (1595-1619 c);
Innocenzo Borgetti (prima del 1640);
Giovanni Battista Benzoni ( ... - ..., 1 lug. 1744);
Giuseppe Carcani (1744-1778);
Giacomo Carcani (1779-1811);
Benedetto Gregori (1811);
Augusto Pelagatti (1848-1865);
Giuseppe Prospero Gallo (1865-1873);
Tito Piroli (1873-1923);
Emilio Gorgni (1933-1968).